Сегодня университет входит в Ассоциацию главных европейских вузов вместе с Оксфордом, Болоньей, Сорбонной, университетом Женевы и так далее. Преподавание ведётся на чешском и английском языках. В Карловом университете 17 факультетов, из которых 14 расположены в Праге, два — в Градце Карлове, один — в Плзне. В настоящее время в университете учатся более 47 000 студентов со всего мира. Факультеты : философский, физико-математический, юридический, 1,2,3 медицинские факультеты. Официальный сайт университета — http://www.cuni.cz